程序定制开发和模板SaaS的区别如下：

1. 定制开发：小程序定制开发是指根据客户的需求进行的一对一开发。开发团队可以根据客户提供的需求，量身定制开发的小程序功能。小程序的界面设计、功能模块、技术选型、数据管理等都是根据客户的需求进行自定义的。

2. SaaS：SaaS是一种在云端运作的应用程序服务。用户可以通过互联网以订阅方式使用该产品。SaaS应用通常是多租户、可扩展、可自定义的。通常情况下，用户可以根据自己的需要从提供商选择增加或减少功能，选择服务器、存储等选项。

3. 定制程度：小程序定制开发的程度更高，可以根据客户的需求进行全面的个性化定制。而SaaS的个性化定制范围相对要小一些，因为SaaS需要考虑多租户和跨客户的共性需求，通常不会针对单独一家企业进行太多的个性化设计。

4. 项目周期：小程序定制开发的周期会相对较长，因为需要根据客户需求进行定制开发。而SaaS产品在提供通用解决方案的同时，可以通过统一的系统部署和调试来提高时间效率。

5. 成本：小程序定制开发的成本相对较高，因为需要根据客户的需求进行全面的定制开发，而SaaS产品相对定价更加亲民，因为它们的产品可以被多个客户分享，相对会有大量的固定流量。