企业网站部署客服系统需要以下步骤：

1. 选择一款适合多店铺的客服系统，如腾讯云客服、Zendesk、Freshdesk等，了解其功能和特点，根据企业实际需求选定。

2. 在客服系统中创建多个部门（或者称之为分组），每个部门对应一个店铺，以便于区分和管理。

3. 在客服系统中设置自动分配规则，将用户的咨询信息根据店铺归属部门进行分配，保证用户能够及时得到回复和解答。

4. 考虑使用智能客服机器人，对一些常见问题进行自动回复，加快客服效率。

5. 在APP或小程序中加入客服入口，以方便用户随时联系客服。同时，也要考虑将入口放置在相应店铺页面，让用户可以一目了然。

6. 建议将客服系统和CRM系统进行集成，将用户信息关联起来，提供更加个性化和贴心的服务。

7. 为了更好地监控和分析客服效果，可以使用相关工具进行数据统计和分析，如Google Analytics、Mixpanel、KISSmetrics等。